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科研合作成果發(fā)表，生物多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析助力醫(yī)學(xué)研究

2024-05-20

多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘在靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。通過整合基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)等多個(gè)組學(xué)層面的數(shù)據(jù)，研究人員可以更全面地理解生物體內(nèi)分子的相互作用和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。這種綜合分析有助于揭示疾病的發(fā)生機(jī)制、識(shí)別潛在的診斷和治療靶點(diǎn)。近期，熱景生物信息中心在組學(xué)數(shù)據(jù)研究上有兩篇成果發(fā)表。

01.《Frontiers in Microbiology》（《微生物學(xué)前沿》）

“The impact of antibiotic exposure on antibiotic resistance gene dynamics in the gut microbiota of inflammatory bowel disease patients”發(fā)表于Frontiers in Microbiology (DOI:10.3389/fmicb.2024.1382332)。該研究基于宏基因組數(shù)據(jù)搭建了腸道菌群耐藥性的分析方法，探究了耐藥基因在腸道菌群中的傳播路徑。

該研究通過分析抗生素使用前后的腸道菌群狀態(tài)，發(fā)現(xiàn)暴露于抗生素可以誘導(dǎo)IBD患者腸道微生物群組成的改變，特別是益生菌的減少，在停止抗生素后逐漸恢復(fù)到新的穩(wěn)定狀態(tài)。并通過網(wǎng)絡(luò)分析揭示了耐藥基因的傾向于在分類學(xué)上接近的生物體之間轉(zhuǎn)移。停止使用抗生素后，特異性耐藥基因的流行率和種間流動(dòng)性增加。

02.《Frontiers in Genetics》（《遺傳學(xué)前沿》）

“In search of the ratio of miRNA expression as robust biomarkers for constructing stable diagnostic models among multi-center data”發(fā)表在Frontiers in Genetics上(DOI:10.3389/fgene.2024.1381917)。該研究開發(fā)了一類生物標(biāo)志物形式，能夠在多中心數(shù)據(jù)中表現(xiàn)穩(wěn)健。

該研究基于轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)的miRNA-miRNA相互作用網(wǎng)絡(luò)，構(gòu)建以miRNA對(duì)的表達(dá)比率作為樣本特征的標(biāo)志物篩選方法，用于建立輔助疾病診斷的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型。該方法在多個(gè)多中心數(shù)據(jù)集中表現(xiàn)優(yōu)越，可以準(zhǔn)確的用于疾病早期診斷。

生信中心為搭建多組學(xué)分析平臺(tái)發(fā)表的兩篇文章受到了審稿人和讀者的廣泛關(guān)注。這些研究成果為深入探索生物體系的復(fù)雜性和發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)志物提供了重要的理論和方法支持。

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